تُعد الأمانة العامة للمحكمة العربية للتحكيم الجهاز الإداري والتنفيذي المسؤول عن تنظيم وإدارة كافة شؤون المحكمة، وتوفير الدعم الفني واللوجستي لهيئات التحكيم واللجان المتخصصة، وضمان حسن سير العمل الإداري والتحكيمي بما يتوافق مع النظام الأساسي واللوائح المعتمدة للمحكمة.